Đại học Tokyo hướng đến mục tiêu trở thành một nền tảng đẳng cấp thế giới cho nghiên cứu và giáo dục, đóng góp vào kiến thức của con người thông qua quan hệ đối tác với các trường đại học toàn cầu hàng đầu khác. Đại học Tokyo hướng đến mục tiêu đào tạo các nhà lãnh đạo toàn cầu có ý thức trách nhiệm công cộng mạnh mẽ và tinh thần tiên phong, sở hữu cả chuyên môn sâu sắc và kiến thức rộng. Đại học Tokyo hướng đến mục tiêu mở rộng ranh giới kiến thức của con người thông qua quan hệ đối tác với xã hội. Chi tiết về cách Đại học thực hiện sứ mệnh này có thể được tìm thấy trong Hiến chương Đại học Tokyo và Kế hoạch hành động.